Obiettivi formativi
Gli studenti acquisiranno nozioni di microbiologia genomica applicate all’investigazione di focolai epidemici di malattia associate al consumo di alimenti, studi di attribuzione della fonte di contagio e di valutazione del rischio. Saranno affrontate tematiche riguardanti le tecnologie e le piattaforme di sequenziamento genomico di nuova generazione (Whole Genome Sequencing, WGS). Nella descrizione delle applicazioni saranno evidenziate le maggiori opportunità e sfide legate a questo nuovo approccio.
Prerequisiti
nessuno
Contenuti dell'insegnamento
Tecnologie e piattaforme di sequenziamento genomico di nuova generazione
Introduzione all’analisi del rischio
Sequenziamento genomico e investigazione di focolai epidemici
Sequenziamento genomico e attribuzione della fonte di contagio (modelli basati sulla frequenza, modelli di intelligenza artificiale, modelli a network)
Studi di associazione genomica e predizione di tratti fenotipici
Sequenziamento genomico e valutazione del rischio (tipizzazione e caratterizzazione batterica per l’identificazione del pericolo; predizione del potenziale di virulenza per la definizione dose-risposta nella caratterizzazione del rischio e predizione di tratti fenotipici associati alla crescita/sopravvivenza del batterio patogeno per la valutazione dell’esposizione al pericolo).
Programma esteso
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Bibliografia
Slides, pubblicazioni scientifiche
Metodi didattici
Lezioni frontali, seminari
Modalità verifica apprendimento
Esame orale. Il voto finale del corso integrato sarà una media dei voti dei due moduli
Altre informazioni
La partecipazione non è obbligatoria ma fortemente consigliata
La docente è disponibile a ricevere gli studenti previo appuntamento da concordare mediante e-mail indirizzata a frederique.pasquali@unibo.it
