METODI DI ANALISI DELLE COMUNITÀ MICROBICHE AMBIENTALI

TECNICHE DI STUDIO DELLE COMUNITÀ MICROBICHE
Metodi tradizionali di analisi basati sulla coltivazione in coltura pura: isolamento e identificazione delle specie microbiche, metodi di identificazione biochimica, metodi sierologici di identificazione e caratterizzazione.
Metodi molecolari per l'identificazione, la tipizzazione e la caratterizzazione applicati ai microrganismi isolati in coltura pura: PCR, analisi mediante elettroforesi su gel di agarosio, clonaggio, sequenziamento, analisi RAPD, rep-PCR, ARDRA, RISA, ARISA etc. Real-time PCR.
Applicazione delle tecniche molecolari allo studio comunità microbiche, senza coltivazione dei microrganismi: isolamento di DNA ambientale, tecniche di fingerprinting genetico ARDRA, SSCP,T-RFLP, DGGE, RISA, LH-PCR, RAPD. Tecniche di sequenziamento massivo e loro applicazione allo studio di comunità microbiche. DNA/RNA Stable isotope probing. Ibridazione fluorescente in situ (FISH CARD-FISH, Raman-FISH, NanoSIMS). Microarray